Université Pierre et Marie Curie

Analyse de données - Ordinations et groupements

Chapitre 1. Introduction
Chapitre 2. L'Analyse en Composantes Principales (ACP)
2.1. Présentation
2.2. Formulaire
2.3. Exemple
2.3.1. Exemple 1
2.3.2. Exemple 2
2.4. Exemple programme Matlab
Chapitre 3. L'Analyse des Correspondances (AFC)
Chapitre 4. L'Analyse des Correspondances Multiples(AFCM)
Chapitre 5. Méthodes de classifications
Chapitre 6. Autres types de groupements.
Chapitre 7. Références
Page d'accueilTable des matièresNiveau supérieurPage précédenteBas de la pagePage suivante

2.3.1. Exemple 1


Exemple d'utilisation de l'Analyse en Composantes Principales


  • Données:

Il s'agit de mesures effectuées sur des poissons de la même espèce capturés à 5 stations (3, 4, 5, 7, 8) sur une radiale à partir d'un émissaire industriel. Les variables sont le poids du poisson (en kg), les concentrations dans les branchies en calcium, cadmium, cuivre, fer, et zinc et la distance en mètres de l'émissaire.
A chaque station 5 poissons ont été échantillonnés.
La matrice d'origine est donc de 25 individus et 7 variables (descripteurs). Les moyennes par stations pour les 5 poissons ont été calculées. Tableau des données.


  • Paramétrisation de l'ACP:
    + L'ACP sera normé (données seront centrées réduites): les variables étant d'unités différentes il est nécessaire de réduire (divisé par l'ecart-type), le centrage lui est une nécessité de la méthode.
    +  Les variables poids et distance seront considérées comme illustratives ou supplémentaires.
    +  Les moyennes par stations seront placées en individus supplémentaires.

  • Exécution de l'ACP sous SPAD:

    acp_fil.jpg (32343 octets)

 

  • Statistiques des variables et Matrice des corrélations.

    acpres1.jpg (42284 octets)

  • Valeurs Propres

    acpres2.jpg (30067 octets)

  • Coordonnées factorielles des Individus, contributions, cosinus carrés (corrélation)

    acpres3.jpg (142852 octets)

  • Corrélations variables-facteurs.

    acpres4.jpg (49168 octets)

 


  • Plan 1/2 : les individus ou objets

    acp1.jpg (36704 octets)

 


  • Plan 1/2 : les variables ou descripteurs

    acp2.jpg (39348 octets)


Exemple de calcul pas par pas de l'ACP en utilisant MATLAB : Ici

 

Page d'accueilTable des matièresNiveau supérieurPage précédenteHaut de la pagePage suivante