Exemple d'utilisation de l'Analyse en Composantes Principales
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Données:
Il s'agit de mesures effectuées sur des caryotypes de mollusques.Chez les 7 espèces d'huîtres creuses étudiées le nombre de chromosomes est de 10 paires .
Un indice chromosomique est calculé pour chaque paire par le rapport entre les dimensions des petits bras et la dimension totale des bras :
Les 7 espèces sont
GI : Crassostrea gigas, AN : Crassostrea angulata, SI : Crassostrea sikamea, VI: Crassostrea virginica, AR : Crassostrea ariakensis, GA : Crassostrea gasar, Saccostrea commercialis
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. Tableau des données.
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Référence : Leitão A., Boudry P., Labat J.P. &Thiriot-Quiévreux C. 1999. Comparative karyological study of cupped oyster species. Malacologia 41, 175-186.
- Paramétrisation de l'ACP:
+ L'ACP sera normée (les données seront centrées réduites): les variabilités des descripteurs étant différentes il est nécessaire de réduire (divisé par l'ecart-type), le centrage lui est une nécessité de la méthode.
+ Les moyennes par espèces seront placées en individus supplémentaires.
Paramétrisation : Variables ,
individus
et généralités .
Exécution
Sorties
Listing :
Statistiques des variables et Matrice des corrélations :
Valeurs propres :
Corrélations variables-facteurs:
Coordonnées factorielles des Individus, contributions, cosinus carrés (corrélation) :
Plan 1/2 : les individus ou objets
Plan 1/2 : les variables ou descripteurs
J. Ph. Labat, mise à jour :
18-11-2004
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